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现任浙江中医药大学教授，主任医师，博士生导师，中华中医药学会方剂分会主任委员，全国中医文献学研究会常务理事，全国政协委员，中国民主促进会浙江省委员会副主任委员。长期从事方剂学的教学工作，治学严谨，1996年被授予“浙江省教师”称号。长期坚持临床，医术精湛，2001年被授予“浙江省名中医”称号。2002年被国家人事部、卫生部、国家中医药管理局确定为“全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师”。编著出版了《历代名方精编》、《金匮方百家医案评议》、《古今奇效单方评议》、《金匮要略校注》、《中医必读》、《连建伟中医传薪录》等著作。并先后担任国家规划教材《方剂学》编委、副主编，主编,协编教材中药专业《方剂学》副主编，共发表专业论文80余篇。《金匮要略校注》获国家中医药管理局1992年度中医药科技进步二等奖。精于脉理，平脉辨证，擅长运用经方及后世各家医方，数方相合，化裁得宜，尤对内科脾胃病有丰富的经验。
连老认为，脾喜燥恶湿，易为湿困，故脾病须细察有无兼湿，然后权衡虚实，孰为主次而兼治之。如湿邪重浊困脾者，首要调畅气机，正如《温病条辨》所云：“气化则湿亦化。”如三仁汤、平胃散、胃苓汤、藿香正气散等随证加减，意在通过芳化、苦燥、淡渗等法祛湿醒脾，复其灵动之性。至于脾气虚弱而生湿者，老师善用温阳法。脾气虚者，临床用四君子汤加减；兼气滞，则加陈皮补气行滞化湿；若兼痰浊，则加制半夏以燥湿化痰。脾气湿者，选用参苓白术散、资生丸健脾、渗湿止泻。如脾阳不足，寒湿内生，症见脘腹冷痛、下利清谷、肢体肿胀等，则善用理中丸或附子理中汤以治之。
对于寒热错杂者，连老强调须详察病机，寒热共调，方符合脾喜温燥、胃喜凉润的特性。当脾受湿困、胃为热扰之际，常用辛开苦降法燥脾清胃，以半夏泻心汤为，寒热互用以和其阴阳，辛苦并进以调其升降，如此则“太阴湿土，得阳始运；阳明燥土，得阴自安”。如泛呕清水甚者改用生姜泻心汤；脾虚审者，则取用甘草泻心汤，佐以茯苓以增健脾化湿之功。若邪热内陷、痰浊蕴结而“心下满痛”者，投以小陷胸汤以降痰火、利气机。连老指出，寒热错杂证，不可拘泥于一法一方，当求本论治，随证加减。实热盛者，适当重用黄芩、黄连，少用干姜，酌加车前子、金钱草、虎杖清热利湿；寒湿盛，重用干姜，少用连，佐以苍术、厚朴苦温燥湿；热毒亢，加蒲公英、白花蛇舌草、半枝莲清热；兼食积者，加焦山楂、焦神曲、焦麦芽。“知犯何逆，随证治之”，虽药有增损，然寒热并调、辛开苦降之旨不变，“谨察阴阳所在而调之，以平为期”。
若胃火蕴结、阳明腑实、脾蕴湿热等实热证候，运用黄连、大黄、龙胆草之类苦寒之药，须详加辨证，否则偾事。若为胃气虚弱，寒凝中焦，误投苦寒方药，则伤阳败胃，或化燥竭阴。此外，胃喜润恶燥，对于木香、砂仁、苍术、厚朴、陈皮等辛香温散之辈，虽有散结消痞之功，用于脾胃气滞、湿阻、食积等证，但若久用重用，也必耗伤胃气。干姜、附子、肉桂等辛热温燥之品，虽有温中散寒之力，然亦不可用之太过，谨防胃之阴津受耗。攻伐之剂，多为峻烈之品，祛邪之力猛，然伤胃之虑亦深，故常佐以草、枣和缓之药，顾护胃气，中病即止，使病退而胃不伤。